东汉后期，多次暴发大疫。而东汉末年，即公元217年，全国发生了一次非常严重的疫情，当时“家家有僵尸之痛，室室有号泣之哀。或阖门而殪，或覆族而丧。”疫病为害之惨烈难以想像。当时许多地方连棺材都卖空了，悲泣声弥漫四周，不管你是富人还是穷人都会传染疫病，贫苦百姓无钱来埋葬家人，所以处处都呈现出“出门无所见，白骨蔽平原”，‘白骨露于野，千里无鸡鸣’的景象。
而处于变动历史时期的三国两晋时期，共发生旱灾六十次，水灾五十六次，风灾五十四次，地震五十三次，雨雹之灾三十五次，疫灾十七次，蝗灾十四次，歉饥十三次，霜雪、“地沸”各两次。
隋朝后期，山东、河南发大水，淹没四十余郡，而且不久出现疾疫。其中山东地区疫情尤为严重，“人多死”。隋朝末年，关中地区疾疫流行，“炎旱伤稼”。唐朝后期到灭亡，也出现了大疫。江淮地区疫病流行的情况是“近者江淮数道，因之以水旱，加之以疾疠，流亡转徙，十室九空。”唐末，淮南出现疫情，造成军队人员和百姓的大量死亡。
南宋末年，浙江永嘉地区大疫，死者众多。这一疫情持续时间很长。在南宋王朝被灭之际，瘟疫再次降临，杭州城内“疫气蒸蒸，人之病死者不可以数计”。
元朝最后一个皇帝顺帝时，是元朝历史上疫病流行最多的时期，史书载有12次之多。平均每三年就有一次瘟疫发生，死人无数。一次京师大疫长达两年之久。
明朝末年，各地的瘟疫是一场连一场。崇祯十四年，京津地区、江苏吴江都遭到大疫袭击，《吴江志》称：“阖门相枕藉，死无遗类者。”十六、十七两年是山西流行瘟疫的高峰。浑源县崇祯十六年大疫，“甚有死灭门者”。崇祯十七年大同府“瘟疫又作”，而灵邱县“瘟疫盛作，死者过半”。南部的潞安大疫，“病者生一核，或吐痰血，不敢吊问，有合家死绝不敢葬者”。崇祯十七年春，吴江再次瘟疫大流行，并持续了一个多月，夺走了大量吴江人的性命。同年，京师鼠疫大作，造成“十室九空，甚至户丁尽绝，无人收敛者”的惨状。
清朝末年似乎也没能摆脱这种厄运，疫病流行十分频繁。光绪帝34年中19年有疫病，宣统帝3年中2年有疫病。当时主要疾病是霍乱、鼠疫和疟疾。1902年，京津地区霍乱流行，死人无数，“有以顷刻死者，有半日死者”。这年黑龙江瑷珲也出现严重的霍乱转筋，半个月后，“市断人稀，街面几无人迹”，每日死亡有七、八百人。 1910年鼠疫在东北流行关内一些地区也被传染到，死亡的人数非常多。
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